Le Coronavirus Covid19

[parisse]

Je pense qu'il manque un facteur 1.5 du a l'imprecision de la periode a laquelle on fait reference et au fait que le nombre de contamines a l'instant t est a peu pres la somme des nouveaux cas pendant les 2 a 3 semaines precedentes. Si on part du nombre de deces en cette fin de semaine, environ 50, et qu'on accepte la valeur de 0.0015% de deces/cas qui serait positif si on pouvait tester toute la population, ca donne un peu plus de 30 000 nouveaux positifs il y a 2 semaines, et plutot de l'ordre de 50 000 nouveaux positifs en cette fin de semaine (et on retrouve 3 fois les 16 000 detectes hier et avant-hier).
SPF donne un R effectif de detection a 1.06 en semaine 38, en baisse par rapport a la semaine precedente (1.09) mais j'ai l'impression que ca va remonter pour la semaine 39 (c'est peut-etre l'effet de la rentree universitaire qui a eu lieu la semaine du 14/9 dans certaines disciplines, le milieu scolaire et universitaire represente 32% des clusters en cours d'investigation). Le R effectif de symptomes/hospitalisation est encore a 1.25 ou 1.28 et devrait suivre le R de detection d'une ou deux semaines.
On peut esperer que la fermeture des bars a 22h dans les grandes villes universitaires suffira a faire descendre le R en-dessous de 1. Ce qui nous amenerait a un plateau de cas dans une bonne semaine vers environ 60 000 cas reels, le reste suivant avec un decalage de 2 semaines. La decroissance serait par contre plus lente qu'au printemps.

[marocain]

que le virus puisse muter, rien d'étonnant...

mais difficile de prévoir en quel sens, surtout sur le long terme.

les virus mutent dans tous les sens, par contre certaines mutations seront sélectionnées.
et la sélection naturelle va toujours dans le même sens:
1. moins létal
ou alors
2. période d'incubation plus longue

[LeLama]

pas besoin d'invoquer une moindre létalité du virus.

Je ne comprends pas pourquoi tu refuses de regarder les donnees. L'ifr est en baisse constante. Par exemple, en angleterre division par presque 3 le mois de juillet pour arriver entre 0.3 et 0.5% suivant les modeles consideres.

Evidemment, ca continue a descendre depuis. Tu prends dans tes hypotheses une ifr aujourd'hui de 0.5%. Ce n'est pas compatible avec les chiffres connus et la descente qui continue ama.

Les chiffres ici: https://www.cebm.net/covid-19/estimatin ... n-england/

Je ne sais pas a combien sera l'ifr finale, quand on aura atteint l'immunité collective. Mais si l'ifr continue a baisser a ce rythme, on sera a moins de 0.1%.... On est peut etre meme deja dans cette zone là. ...

[GillesH38]

pas besoin d'invoquer une moindre létalité du virus.

Je ne comprends pas pourquoi tu refuses de regarder les donnees. L'ifr est en baisse constante. Par exemple, en angleterre division par presque 3 le mois de juillet pour arriver entre 0.3 et 0.5% suivant les modeles consideres.

Evidemment, ca continue a descendre depuis. Tu prends dans tes hypotheses une ifr aujourd'hui de 0.5%. Ce n'est pas compatible avec les chiffres connus et la descente qui continue ama.

Les chiffres ici: https://www.cebm.net/covid-19/estimatin ... n-england/

Je ne sais pas a combien sera l'ifr finale, quand on aura atteint l'immunité collective. Mais si l'ifr continue a baisser a ce rythme, on sera a moins de 0.1%.... On est peut etre meme deja dans cette zone là. ...

non j'ai dit qu'il avait pu baisser grâce à une amélioration des soins et une distribution différente en âge (ce dernier facteur pouvant étre identifié si on évalue un ifr par classe d'âge, as tu des données la dessus ? )
mais l'hypothèse qu'on aurait 5% de positifs dans toute la population amènerait à un IFR de 0,06 %, trop petit d'après les mesures que tu cites.

[LeLama]

mais l'hypothèse qu'on aurait 5% de positifs dans toute la population amènerait à un IFR de 0,06 %, trop petit d'après les mesures que tu cites.

Un peu trop petit, mais pas tant que ce. Si la baisse s'est poursuivie au meme rythme qu'au mois de juillet, l'ifr actuel est autour de 0.11%. Mais il peut avoir baissé davantage avec la rentree universitaire et lyceenne et les fêtes associées, car les jeunes ont un ifr nettement plus petit.

Par exemple, on trouve des estimations comme ca en ligne. Donc les ifr des moins de 50ans sont quasiment equivalentes a 0 dans le calcul.
0-19 years: 0.00003
20-49 years: 0.0002
50-69 years: 0.005
70+ years: 0.054

[LeLama]

La source pour les ifr par age:
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nc ... arios.html

Noter que 5% pour la tranche d'age 70+, c'est la mortalité de la grippe.

[LeLama]

Et aux states, un echantillon suivi du 26 au 30 avril. IFR de 0.26% au total et 0.18% pour les blancs. L'ifr reel était probablement plus petit car les moins de 12 ans ont été exclu. Et evidemment, on a baissé depuis.

https://www.acpjournals.org/doi/10.7326/M20-5352

Il faut etre prudent, mais tous ces chiffres semblent confirmer qu'on doit maintenant etre dans une zone ou le covid n'est pas tellement plus dangereux que la grippe individuellement ( ifr entre 0.05 et 0.1% ), meme si ca continuera a faire des morts à cause de la contagion et du grand nombre de malades.

[alain2908]

nombre d'hospitalisation dans les 7 derniers jours https://elpais.com/sociedad/2020/07/27/ ... 08240.html
Ca donne 1 976 pour l'Espagne au 14 septembre (42 par million d'habitants)
En France, on est à 1 706 à la date de vendredi dernier. (26 par million d'habitants) https://www.santepubliquefrance.fr/mala ... embre-2020

au Vendredi 18, ça donnait :
Espagne 2485 hospitalisations soit 54,02 par million
France ..2465 hospitalisations soit 37,92 par million (contre 26 en S-1)

au 25 septembre, la situation s'aggrave fortement en France alors qu'elle se stabilise en Espagne.
Espagne 2494 hospitalisations sur les 7 derniers jours soit 54,22 par million
France ..4 069 hospitalisations soit 62 par million

[GillesH38]

mais l'hypothèse qu'on aurait 5% de positifs dans toute la population amènerait à un IFR de 0,06 %, trop petit d'après les mesures que tu cites.

Un peu trop petit, mais pas tant que ce. Si la baisse s'est poursuivie au meme rythme qu'au mois de juillet, l'ifr actuel est autour de 0.11%. Mais il peut avoir baissé davantage avec la rentree universitaire et lyceenne et les fêtes associées, car les jeunes ont un ifr nettement plus petit.

c'est possible, mais je disais juste que rien ne montrait de façon assurée que le virus avait perdu de sa virulence.
D'ailleurs si il y a une mutation elle se produit a priori a un endroit et se propage ensuite, mais elle ne peut pas concerner tous les pays en même temps.

[GillesH38]

Et aux states, un echantillon suivi du 26 au 30 avril. IFR de 0.26% au total et 0.18% pour les blancs. L'ifr reel était probablement plus petit car les moins de 12 ans ont été exclu. Et evidemment, on a baissé depuis.

https://www.acpjournals.org/doi/10.7326/M20-5352

Il faut etre prudent, mais tous ces chiffres semblent confirmer qu'on doit maintenant etre dans une zone ou le covid n'est pas tellement plus dangereux que la grippe individuellement ( ifr entre 0.05 et 0.1% ), meme si ca continuera a faire des morts à cause de la contagion et du grand nombre de malades.

le problème est aussi que la population étant encore largement naïve et non vaccinée, contrairement à la grippe, les morts peuvent être concentrés sur quelques semaines si on "laisse filer", saturer les services d'hospitalisation, et créer d'autres morts soit de la covid car ils n'ont pas pu etre hospitalisé, soit pour les autres causes qui auront aussi été sans soins par suite de l'encombrement des services. L'idéal étant d'accepter une certaine contamination pour immuniser, mais pas trop. Pas facile ... (face à un processus pouvant diverger exponentiellement, ça s'apparente au contrôle d'un réacteur nucléaire).

[LeLama]

Je m'amusais a objectiver la baisse de letalité.

Mi-mai : taux de positivité 2,2% environ, aux environs de 50 morts par jour 3 semaines plus tard.
Aujourd'hui : taux de positivité 5.5% environ il y a 3 semaines, en ce moment meme nb de morts envrion une cinquantaine par jour.

Ca ferait a la grosse louche un ifr qui a été réduit d'un facteur de 2.5 entre mi-mai et debut septembre.

[GillesH38]

Je m'amusais a objectiver la baisse de letalité.

Mi-mai : taux de positivité 2,2% environ, aux environs de 50 morts par jour 3 semaines plus tard.
Aujourd'hui : taux de positivité 5.5% environ il y a 3 semaines, en ce moment meme nb de morts envrion une cinquantaine par jour.

Ca ferait a la grosse louche un ifr qui a été réduit d'un facteur de 2.5 entre mi-mai et debut septembre.

quel était la proportion de +65 ans dans les positifs, dans les deux cas ?

[kercoz]

quel était la proportion de +65 ans dans les positifs, dans les deux cas ?

C'est une stat importante qui n'est jamais fournie ( à ma connaissance), pourtant facile à cerner ( la stat, pas ma connaissance !)

[energy_isere]

1 million de morts du covid-19



https://i.postimg.cc/g2sRRhQF/940eda90a ... 60x638.jpg

[parisse]

Je m'amusais a objectiver la baisse de letalité.

Mi-mai : taux de positivité 2,2% environ, aux environs de 50 morts par jour 3 semaines plus tard.
Aujourd'hui : taux de positivité 5.5% environ il y a 3 semaines, en ce moment meme nb de morts envrion une cinquantaine par jour.

Ca ferait a la grosse louche un ifr qui a été réduit d'un facteur de 2.5 entre mi-mai et debut septembre.

quel était la proportion de +65 ans dans les positifs, dans les deux cas ?

Covidtracker donne par tranches de 10 ans, pour 70+ le %age est divise par 2.5 entre mi-mai et debut septembre. Pour 60+ on a un facteur 2.
Je pense qu'il faut rester mefiant sur ces comparaisons pour deux autres raisons: le taux de positivite peut etre perturbe par le fait qu'on teste entre 3 et 4 fois plus maintenant que mi-mai, et puis on n'est pas dans la meme sequence de l'epidemie: mi-mai on etait en phase descendante, actuellement on est en phase ascendante (il y a donc moins de morts maintenant que mi-mai pour des durees d'hospitalisation longues).